As variações da coluna d'água no ambiente aquático, motivadas por processos naturais ou antropogênicos, podem afetar a estabilidade de metais-traço no sedimento do Complexo Portuário de Santos (CPS), localizado no sudeste do Brasil. Metais-traço, como Cu, Zn, Ni, Pb e Cd, podem afetar negativamente os compartimentos ecológicos e biológicos da água estuarina. Para avaliar a condição do sedimento do CPS, este artigo investigou a fração geoquímica de metais-traço sedimentares aplicando a abordagem de extração sequencial BCR (European Community Bureau of Reference - Gabinete de Referência da Comunidade Europeia). A matéria orgânica e o tamanho de grão fino, característicos de um ambiente estuarino, mostraram uma influência direta na dinâmica de concentração de metais-traço em sedimentos, especialmente para Pb, Cd e Ni. No caso específico de Zn e Cu, havia uma possível fonte de contaminação no porto. A maior fração dos metais estudados era não residual, potencialmente mobilizável em um ambiente em que a variação dos parâmetros físico-químicos da coluna d'água é altamente variável, algo frequente em ambientes estuarinos.
Palavras-chave: especiação de metais-traço; Porto de Santos; sedimento; impacto ambiental.